第1部分

Mengsk和Raynor。在此期间，Duran出卖了UED，使DuGalle上将和Stukov中将反目，并杀死了Stukov，同时也暴露了自己的叛变。在Braxis行星上，UED重组了幽能干扰器，不过这使得UED必须分兵防守Braxis和Korhal两个行星。虽然干扰器给Kerrigan控制Zerg造成了很多麻烦，然而仅仅用一支行星驻军来保护它是个致命的错误，这给UED在Koprulu星区的失败敲响了丧钟。

宇宙中最强悍的女王

不久，UED攻占Char行星，捕获了新主宰。Kerrigan告诉DuGalle，她会消灭所有UED控制的所有Zerg。

在控制了一个脑虫后，Kerrigan决定开始和Arcturus　Mengsk、Fenix和Raynor一起对抗UED。Mengsk只是她的俘虏，她威胁Mengsk说，如果拒绝合作，Mengsk余生只能做囚室中的皇帝。于是联军摧毁了能量干扰器，甚至感染了Moria行星上的平民。随后Kerrigan击败了Korhal行星上的UED。然而就在联盟休整的空虚时期，Kerrigan打破联盟，并杀死了Fenix和Mengsk的将军Edmund　Duke。Raynor和Mengsk则逃脱了。对于Kerrigan的背叛，Raynor感到痛苦万分，他发誓要Kerrigan为此付出死的代价。

在打退UED的反击后，Kerrigan计划消灭新主宰。她再次回到Shakuras行星，去寻找女族长Raszagal。在Raszagal的命令下，黑暗圣堂武士没有启动Xel'Naga神庙。于是Kerrigan成功地绑架走了Raszagal。（事实上，是被控制的Raszagal自愿跟随而去的。）

复仇心切的Zeratul和Artanis尾随Kerrigan回到Char。Zeratul要求Kerrigan释放Raszagal，Kerrigan则提出Zeratul在杀死主宰后，她才释放Raszagal。Raszagal也让Zeratul听从Kerrigan的建议，声称主宰是对Kerrigan和Protoss的双重威胁。

虽然Zeratul知道杀死主宰只会让Kerrigan变得更加强大，但他没有别的选择，只能同意。黑暗圣堂武士参与了战斗，并消灭了Zerg和UED的联合部队，他也杀死了主宰。当他再次提出释放

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